Станция является правопреемником Анапского опытного поля по виноградарству, созданного по постановлению Военного Совета Кубанского казачьего войска от 21 июня 1910 года.

Постановлением земельного съезда Кубано-Черноморской области от 16 июня 1920 года на базе опытного поля виноградо-винодельческого показательного хозяйства была образована  Областная опытная станция по виноградарству и виноделию.

 С 1  сентября 1922 года  по решению Кубано-Черноморского областного земельного отдела Наркомата земледелия РСФСР она переименована в Анапскую районную опытную станцию по виноградарству и виноделию. С 1923 года станция находилась в ведении Наркомзема РСФСР. Постановлением  Совета народных комиссаров РСФСР от 29 октября 1931 года за № 1135 «О рационализации сети научно-исследовательских учреждений РСФСР» название было изменено на Анапскую зональную опытную станцию по виноградарству и виноделию.

Согласно Постановлению Совета Министров РСФСР от 17 января 1979 года и приказу ВРО ВАСХНИЛ от 16 февраля 1979 года № 1 Учреждение было передано в непосредственное подчинение ВРО ВАСХНИЛ.

На основании Указа Президента Российской Федерации от 30 января 1992 года № 84 «О Российской академии сельскохозяйственных наук» на базе Российской академии сельскохозяйственных наук и Всесоюзной академии сельскохозяйственных наук создана единая Российская академия сельскохозяйственных наук . Согласно упомянутому выше Указу Президента Российской Федерации  Государственное научное учреждение Анапская зональная опытная станция виноградарства и виноделия   передана в Россельхозакадемию.

В соответствии с Федеральным законом от 27 сентября 2013 г. № 253-ФЗ «О Российской академии наук, реорганизации государственных академий наук и внесении изменений в отдельные законодательные акты Российской Федерации» и распоряжением Правительства Российской федерации от 30 декабря 2013г. № 2591-р  опытная станция передана в ведение Федерального агентства научных организаций (ФАНО России).

Станция координировала научные исследования в Северо-Кавказском регионе, проводила научные исследования в Черноморской зоне Краснодарского края, с 1928 г. издавала собственные труды по основным направлениям развития отрасли - системам ведения виноградарства, клоновой селекции, содержанию почвы, микроудобрениям, развитию корневых систем, защите винограда от болезней и вредителей, микровиноделию, новым расам винных дрожжей, технологической оцен­ке сортов винограда, хранению столовых сортов и т.п.

В разные годы на станции работали ученые с мировым именем: профес­сора: А.С. Мержаниан, A.M. Фролов-Багреев, В.В. Флеров, В.В, Акимцев, А.И.Краснянский, А.С. Щербаков, П.Т. Болгарев; кандидаты сельскохозяйственных наук: П.П. Благонравов, С.Ф. Серпуховитина, Л.Н. Ма­каров-Кожухов, К.С. Рузаев, А.Д. Ли­пецкая, Г.В.Огиенко, П.В. Коробец, Э.А. Асриев, Ю.И. Шуйская, Г.А. Зоткина, Н.В. Папонов, Машинская Л.П. Более 22 лет руководил станцией доктор сельскохозяйствен­ных наук, Лауреат Государственной премии России в области науки 1992 г.), Лауреат премии Правительства Российской федера­ции (2002 г.), Лауреат премии Министерства сельского хозяй­ства и дважды администрации Краснодарского края (в 1988 и 2004 гг.), заслуженный деятель науки Кубани, заслуженный ра­ботник сельского хозяйства России, академик Международной академии ви­нограда и вина А.И. Жуков.

Всю трудовую жизнь посвятил станции доктор сельскохозяйственных наук, Лауреат Государственной премии России в области науки (1992 г.), Лауреат премии Правительства Российской федерации в области науки (2002 г.), дважды Лауреат премии администрации Краснодарского края (1988 и 2004 г.), заслуженный агроном России, заслуженный деятель науки Кубани Н.Н. Перов.

Основные виды деятельности станции.

Основными целями деятельности Станции являются проведение фундаментальных, поисковых и прикладных научных исследований, внедрение достижений науки и передового опыта, направленных на получение новых знаний в отрасли виноградарства и виноделия, способствующих технологическому, экономическому и социальному развитию агропромышленного комплекса.

В своей деятельности Станция руководствуется также следующими целями: а) всемерное содействие развитию науки в отрасли виноградарства и виноделия; б) укрепление связей между наукой и производством в отрасли виноградарства и виноделия; в) участие в инновационной деятельности, реализации достижений науки и техники; г) издание научных трудов, материалов конференций, методических указаний, монографий и другой научно-технической продукции; оказание научно-консультационных услуг; д) участие в региональных и международных выставках и конкурсах (дегустациях) вин с целью пропаганды достижений науки в отрасли виноградарства и виноделия.

Основные достижения.

Сохраняется на постоянной основе, как российский генетический ресурс, генофонд винограда, включающий 4891 генетических сорто-образцов; создано 68 сортов винограда, 6 подвоев. В настоящее время в Государственный реестр включено 39 сортов, которые возделываются в зоне Северного Кавказа на площади около 3,5 тысяч. га.

В активе станции 17 поддерживаемых патента.

За последние 5 лет разработано 4 инструментально-аналитические методики исследования качества посадочного материала винограда, 1 стандарт организации, 8 технологических инструкций; издано 25 монографий, научно-практических и методических пособии и рекомендаций; проведено 40 образовательных и научно-практических семинаров с отраслевыми специалистами и фермерами с общим числом слушателей 700 человек.

За годы деятельности разработано более 5 эффективных ресурсосберегающих, экологически безопасных технологий возделывания винограда в зоне Северного Кавказа.

Конечные потребители продукции: Минсельхоз России; Министерство сельского хозяйства Краснодарского края; работники руководящих органов сельского хозяйства, агрофирм и фермерских хозяйств; научно-исследовательские учреждения и учреждения высшего и средне-специального образования; Государственная семенная инспекция, Государственная комиссия по сортоиспытанию сельскохозяйственных культур, организации занимающиеся проектированием проектно-сметной документации для закладки виноградных насаждений.

Опытно-экспериментальная база

Всероссийская ампелографическая коллекция площадью 15,66 га., маточник подвойных лоз 0,72 га., маточник привойных лоз 25,1 га., производственные виноградники 21,94 га.